GNE-6641 ถูกนำมาใช้หลักๆ ในด้านการวิจัยมะเร็ง โดยทำหน้าที่เป็นตัวยับยั้ง ubiquitin-specific protease 7 (USP7) ที่มีประสิทธิภาพสูงและเลือกสรรได้ดี เอนไซม์นี้มีบทบาทสำคัญในการควบคุมความเสถียรและการทำงานของโปรตีนหลักที่เกี่ยวข้องกับการยับยั้งเนื้องอกและการเกิดมะเร็ง โดยการยับยั้ง USP7 GNE-6641 จะรบกวนเส้นทางการย่อยสลายของโปรตีนยับยั้งเนื้องอก ทำให้โปรตีนเหล่านั้นสะสมและกระตุ้นการตอบสนองต้านมะเร็งตามมา กลไกนี้ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าต่อการศึกษาบทบาทของ USP7 ในชีววิทยาของมะเร็ง และการสำรวจกลยุทธ์การรักษาที่มุ่งเป้าไปที่เส้นทางการย่อยสลายโปรตีน นอกจากนี้ GNE-6641 ยังถูกใช้ในการศึกษาก่อนคลินิกเพื่อประเมินประสิทธิภาพในโมเดลมะเร็งต่างๆ ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับศักยภาพในฐานะยาต้านมะเร็งชนิดใหม่ ความเลือกสรรและประสิทธิภาพสูงยังทำให้เป็นสารประกอบที่มีประโยชน์ในการสำรวจการทำงานทางชีวภาพที่กว้างขึ้นของ USP7 ในกระบวนการเซลล์นอกเหนือจากมะเร็ง