5-เมทอกซี-2H-โครเมน-2-วัน ถูกนำมาใช้หลักในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ต่างๆ โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารเคมีเกษตร สารนี้ทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญในการผลิตยาต้านการแข็งตัวของเลือด ซึ่งมีความสำคัญในการป้องกันการเกิดลิ่มเลือดในผู้ป่วยที่มีภาวะหัวใจและหลอดเลือด นอกจากนี้ยังถูกใช้ในการสร้างสีย้อมเรืองแสงและโพรบ ซึ่งเป็นเครื่องมือสำคัญในการวิจัยทางชีวเคมีสำหรับการติดตามและแสดงภาพกระบวนการในเซลล์ บทบาทของมันในการสังเคราะห์อินทรีย์ยังขยายไปถึงการเตรียมน้ำหอมและสารปรุงรส ซึ่งมีส่วนช่วยในคุณสมบัติทางประสาทสัมผัสของผลิตภัณฑ์สำหรับผู้บริโภค นอกจากนี้ยังมีการสำรวจในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการพัฒนาไดโอดเรืองแสงอินทรีย์ (OLEDs) และวัสดุขั้นสูงอื่นๆ