ซิลิกาเจลสำหรับโครมาโตกราฟีแบบคอลัมน์และชั้นบางถูกใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการแยกและวิเคราะห์สารเคมีในห้องปฏิบัติการ เนื่องจากมีคุณสมบัติในการดูดซับที่ดีและสามารถแยกสารต่าง ๆ ได้อย่างมีประสิทธิภาพ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเคมี ชีวเคมี และเภสัชวิทยา มักใช้ในการแยกสารประกอบอินทรีย์ สารธรรมชาติ หรือแม้กระทั่งสารชีวโมเลกุล เช่น โปรตีนและกรดนิวคลีอิก นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการผลิตยาเพื่อแยกและทำให้สารบริสุทธิ์ก่อนนำไปใช้ในขั้นตอนต่อไป ซิลิกาเจลนี้ยังสามารถปรับแต่งได้ตามความต้องการของงาน เช่น การเลือกขนาดอนุภาคหรือการปรับสภาพพื้นผิวเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพในการแยกสารเฉพาะชนิด