ใช้เป็นตัวเรนเจนต์สำหรับการทำอนุพันธ์ในเคมีวิเคราะห์ โดยเฉพาะในก๊าซโครมาโตกราฟีและสเปกโตรเมตรีมวล เพื่อเพิ่มความระเหยและความเสถียรทางความร้อนของสารประกอบขั้ว เช่น กรดคาร์บอกซิลิกและแอลกอฮอล์ กลุ่มเพนตาฟลูออโรโพรพิโอนิลที่มีการดึงอิเล็กตรอนแรงช่วยปรับปรุงความไวในการตรวจจับในอิเล็กตรอนแคปเจอร์และการไอออนไนเซชันเคมีลบสเปกโตรเมตรีมวล เนื่องจากมีฟลูออรีนสูง นิยมใช้ในการวิเคราะห์สิ่งแวดล้อมและเภสัชกรรมสำหรับการตรวจจับระดับร่องรอยของสารปนเปื้อนกรดและเมตาโบไลต์ นอกจากนี้ยังใช้เป็นตัวเรนเจนต์ในการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับการนำกลุ่มอะซิลฟลูออรีนเข้าไป ซึ่งสามารถมีผลต่อความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและลิโพฟิลิกของโมเลกุลชีวภาพ