(S)-Methyl 2-aminobutanoate hydrochloride ใช้หลักในการสังเคราะห์สารประกอบชิรัล โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) และเคมีภัณฑ์ละเอียด ลักษณะชิรัลของมันทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างสารบริสุทธิ์ทางเอนานติโอเมอร์ ซึ่งจำเป็นสำหรับการพัฒนายาที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะและผลข้างเคียงที่ลดลง นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อสร้างโมเลกุลซับซ้อน รวมถึงอนุพันธ์กรดอะมิโนและเปปไทด์ ซึ่งมีความสำคัญในเคมียารักษาและการวิจัยชีวเคมี