Desfluoro-ezetimibe ใช้หลักในการวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะในการศึกษายับยั้งการดูดซึมคอเลสเตอรอล มันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญหรือสารอ้างอิงในการสังเคราะห์ ezetimibe ซึ่งเป็นยาที่ใช้จัดการภาวะคอเลสเตอรอลในเลือดสูงโดยลดการดูดซึมคอเลสเตอรอลในลำไส้ นักวิจัยใช้ desfluoro-ezetimibe เพื่อทำความเข้าใจความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและกิจกรรม (structure-activity relationship) และปรับปรุงประสิทธิภาพของยาลดคอเลสเตอรอล นอกจากนี้ ยังช่วยในการพัฒนาวิธีการวิเคราะห์สำหรับการควบคุมคุณภาพและการศึกษเภสัชจลนศาสตร์ เพื่อให้มั่นใจในความปลอดภัยและประสิทธิผลของตัวยาที่เกี่ยวข้อง