มาโทเฮกซาโอสถูกใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมอาหารเป็นส่วนผสมฟังก์ชัน โดยเฉพาะในการปรุงเครื่องดื่มกีฬาและเครื่องดื่มให้พลังงาน ความสามารถในการปล่อยกลูโคสอย่างต่อเนื่องทำให้เป็นแหล่งคาร์โบไฮเดรตที่เหมาะสมสำหรับนักกีฬาและบุคคลที่ต้องการพลังงานยาวนาน นอกจากนี้ ยังใช้ในการผลิตเบเกอรี่พิเศษเพื่อเพิ่มเนื้อสัมผัสและการกักเก็บความชื้น ในภาคเภสัชกรรม มาโทเฮกซาโอสทำหน้าที่เป็นสารช่วยในสูตรเม็ดยา เพื่อปรับปรุงความเสถียรและอัตราการละลาย การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่ชีวเทคโนโลยี ที่ซึ่งใช้เป็นสารตั้งต้นในการทดสอบเอนไซม์และการศึกษาวิจัยที่มุ่งเน้นการเผาผลาญคาร์โบไฮเดรต