D-Fructose 6-phosphate disodium salt hydrate ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในด้านชีวเคมีและชีววิทยาโมเลกุล โดยเฉพาะในกระบวนการศึกษาเกี่ยวกับเมแทบอลิซึมของคาร์โบไฮเดรต เป็นสารตั้งต้นสำคัญในเส้นทางการเผาผลาญกลูโคส (glycolysis) และเส้นทางการสังเคราะห์ด้วยแสง (photosynthesis) นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยเกี่ยวกับเอนไซม์ เช่น hexokinase และ phosphofructokinase เพื่อศึกษากลไกการทำงานและความสำคัญของเอนไซม์เหล่านี้ในกระบวนการเมแทบอลิซึม ในทางคลินิก อาจใช้ในการศึกษาความผิดปกติทางเมแทบอลิซึม เช่น โรคเบาหวาน หรือภาวะดื้ออินซูลิน เพื่อทำความเข้าใจกลไกทางชีวเคมีที่เกี่ยวข้อง