6-Chloropurine riboside ถูกใช้หลักในการวิจัยทางชีวเคมีเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์อนุพันธ์นิวคลีโอไซด์ต่างๆ ซึ่งอนุพันธ์เหล่านี้มีความสำคัญในการศึกษากระบวนการเซลล์ โดยเฉพาะในการทำความเข้าใจการเผาผลาญกรดนิวคลีอิกและการทำงานของเอนไซม์ มันทำหน้าที่เป็นสารกลางในการพัฒนายาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง โดยการรวมเข้าไปในกรดนิวคลีอิกสามารถยับยั้งการสืบพันธุ์ของไวรัสหรือการเพิ่มจำนวนของเซลล์มะเร็ง นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษากลไกการกู้คืนพิวรีน ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับความผิดปกติทางพันธุกรรมที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญพิวรีน บทบาทของมันในการปรับเปลี่ยนเส้นทางชีวเคมีทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการค้นพบยาและการวิจัยชีววิทยาโมเลกุล