มอลโตเตตระโอส ถูกใช้ในหลายด้าน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมอาหารและชีววิทยา มันทำหน้าที่เป็นซับสเตรตในการศึกษาการทำงานของเอนไซม์ที่ย่อยคาร์โบไฮเดรต เช่น แอมิเลส ซึ่งช่วยให้เข้าใจกลไกการย่อยน้ำตาลในร่างกายได้ดีขึ้น นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการผลิตน้ำตาลไซรัปที่มีความเข้มข้นเฉพาะตัว โดยช่วยควบคุมความหวานและเนื้อสัมผัสของผลิตภัณฑ์อาหาร ยังมีการวิจัยเกี่ยวกับการใช้มอลโตเตตระโอสเป็นพรีไบโอติกที่อาจส่งเสริมการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์ที่ดีในลำไส้ ทำให้มีศักยภาพในการนำไปใช้ในผลิตภัณฑ์เพื่อสุขภาพ