ใช้สารละลายกลูตารัลดีไฮด์เป็นสารฆ่าเชื้อโรคและสารทำให้โปรตีนแข็งตัวในอุตสาหกรรมทางการแพทย์และสุขภาพ โดยเฉพาะอย่างยิ่งใช้สำหรับการฆ่าเชื้ออุปกรณ์ทางการแพทย์ที่ไม่สามารถทนความร้อนได้ เช่น กล้องส่องทางเดินหายใจ กล้องส่องกระเพาะอาหาร และเครื่องมือผ่าตัดบางชนิด เนื่องจากมีประสิทธิภาพในการฆ่าแบคทีเรีย ไวรัส รา และสปอร์ นอกจากนี้ยังใช้ในห้องปฏิบัติการชีววิทยาเพื่อทำให้เซลล์หรือเนื้อเยื่อคงรูป (fixation) ก่อนการศึกษาภายใต้กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอน เพราะช่วยรักษาโครงสร้างเซลล์ให้อยู่ในสภาพใกล้เคียงของจริง ในอุตสาหกรรมอื่นๆ ยังใช้เป็นสารต้านจุลินทรีย์ในของเหลวต่างๆ เช่น น้ำมันเจาะในอุตสาหกรรมปิโตรเลียม หรือใช้ในกระบวนการบำบัดน้ำเพื่อควบคุมการเจริญเติบโตของแบคทีเรียและสาหร่าย อย่างไรก็ตาม สารนี้มีพิษและอาจก่อให้เกิดการระคายเคืองต่อผิวหนัง ตา และระบบทางเดินหายใจ จึงต้องใช้ด้วยความระมัดระวังและภายใต้การระบายอากาศที่ดี