บัฟเฟอร์ซิเตรตถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในหลากหลายสาขาทางวิทยาศาสตร์และอุตสาหกรรม เนื่องจากมีความสามารถในการควบคุม pH ได้อย่างมีประสิทธิภาพ ในทางชีววิทยาและชีวเคมี มักใช้เป็นส่วนประกอบในสารละลายบัฟเฟอร์สำหรับการทดลองที่เกี่ยวข้องกับเอนไซม์และโปรตีน เพื่อรักษาสภาพแวดล้อมที่เหมาะสมสำหรับปฏิกิริยา นอกจากนี้ ยังใช้ในกระบวนการแยกและทำให้บริสุทธิ์ของดีเอ็นเอและอาร์เอ็นเอ เพื่อป้องกันการสลายตัวของกรดนิวคลีอิก ในด้านเภสัชกรรม บัฟเฟอร์ซิเตรตถูกใช้ในการผลิตยาชนิดต่าง ๆ เพื่อรักษาความเสถียรของยาและควบคุม pH ให้เหมาะสมสำหรับการดูดซึมในร่างกาย นอกจากนี้ ยังพบการใช้งานในอุตสาหกรรมอาหารและเครื่องดื่ม เพื่อปรับสภาพ pH และยืดอายุการเก็บรักษาของผลิตภัณฑ์ ในทางวิศวกรรมสิ่งแวดล้อม บัฟเฟอร์ซิเตรตถูกใช้ในการบำบัดน้ำเสีย เพื่อช่วยปรับสมดุล pH และเพิ่มประสิทธิภาพของกระบวนการบำบัด รวมถึงใช้ในการวิจัยทางเคมีวิเคราะห์ เป็นส่วนประกอบในสารละลายมาตรฐานสำหรับการวัดค่า pH และการไทเทรต