MES Buffer ใช้เป็นสารบัฟเฟอร์ในกระบวนการทางชีวเคมีและโมเลกุลชีววิทยา เนื่องจากมีความเสถียรในช่วง pH 5.5-6.7 ทำให้เหมาะสมสำหรับการใช้งานในห้องปฏิบัติการ เช่น การแยกโปรตีน การวิเคราะห์ด้วยอิเล็กโตรโฟรีซิส และการเพาะเลี้ยงเซลล์ นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการสังเคราะห์ทางเคมีและการวิจัยทางเภสัชวิทยาเพื่อรักษาสภาพ pH ที่เหมาะสมในปฏิกิริยาต่างๆ MES Buffer ยังเป็นที่นิยมในการศึกษาเกี่ยวกับเอนไซม์และโครงสร้างของโปรตีน เนื่องจากไม่รบกวนการทำงานของเอนไซม์และไม่ก่อให้เกิดผลข้างเคียงในระบบชีวภาพ