CAPS buffer ใช้อย่างแพร่หลายในงานชีวเคมีและชีววิทยาโมเลกุล เนื่องจากมีช่วงการบัฟเฟอร์ที่มีประสิทธิภาพที่ระดับ pH สูง โดยทั่วไประหว่าง 9.7 ถึง 11.1 มักใช้ในอิเล็กโทรโฟรีซิสโปรตีน โดยเฉพาะ SDS-PAGE ซึ่งช่วยรักษาสภาพแวดล้อม pH ที่เสถียรสำหรับการแยกโปรตีน CAPS buffer ยังใช้ใน Western blotting เป็นบัฟเฟอร์สำหรับการถ่ายโอนโปรตีน เพื่อให้มั่นใจในการถ่ายโอนโปรตีนจากเจลไปยังเมมเบรนอย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ ยังใช้ในงานทดสอบเอนไซม์และปฏิกิริยาชีวเคมีอื่นๆ ที่ต้องการสภาวะด่าง ความเข้ากันได้กับระบบชีวภาพต่างๆ ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในห้องปฏิบัติการวิจัยและวินิจฉัย