(3,5-Difluoro-2-nitrophenyl)boronic acid ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในด้านการสังเคราะห์สารเคมี โดยเฉพาะในปฏิกิริยา cross-coupling reactions เช่น Suzuki-Miyaura coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่สำคัญในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบอะโรมาติกและสารประกอบโบรอนิก ตัวนี้มักใช้เป็นสารตั้งต้นในการผลิตสารประกอบอินทรีย์ที่มีความซับซ้อนมากขึ้น ซึ่งมีประโยชน์ในอุตสาหกรรมยาและวัสดุศาสตร์ นอกจากนี้ ยังสามารถใช้ในการศึกษาด้านเคมีวิเคราะห์และเป็นรีเอเจนต์ในกระบวนการตรวจจับหรือแยกสารเฉพาะทางอีกด้วย