N-(2-Aminoethyl)maleimide Hydrochloride ถูกใช้อย่างแพร่หลายในงานชีวเคมีและการไบโอคอนจูเกชัน เนื่องจากความสามารถในการทำปฏิกิริยากับหมู่ไธออล มันถูกนำมาใช้บ่อยในการปรับเปลี่ยนโปรตีน เปปไทด์ และชีวโมเลกุลอื่นๆ โดยการติดต่อแบบเลือกสรรกับสารตกค้างซิสเตอีน ทำให้สามารถศึกษากโครงสร้าง หน้าที่ และปฏิสัมพันธ์ของโปรตีน สารประกอบนี้ยังถูกใช้ในการเตรียมแอนติบอดี-ยาคอนจูเกต (ADCs) สำหรับการรักษามะเร็งแบบกำหนดเป้าหมาย โดยเชื่อมโยงยาที่มีพิษต่อเซลล์กับแอนติบอดี นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นสารเชื่อมขวางในการพัฒนาเซ็นเซอร์ชีวภาพและเครื่องมือวินิจฉัย ช่วยในการยึดติดชีวโมเลกุลบนพื้นผิวเพื่อวัตถุประสงค์ทางวิเคราะห์ บทบาทของมันในการติดฉลากและติดตามชีวโมเลกุลในการวิจัยยังเน้นย้ำถึงความสำคัญในชีววิทยาโมเลกุลและชีวเคมี