ยูบิควิตินจากเม็ดเลือดแดงวัวถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีวเคมีและโปรตีโอมิกส์เพื่อศึกษากระบวนการย่อยสลายและควบคุมโปรตีน มันมีบทบาทสำคัญในเส้นทางยูบิควิติน-โปรติเอซโซม โดยที่มันติดแท็กโปรตีนเพื่อการย่อยสลาย ช่วยให้นักวิจัยเข้าใจกลไกเซลล์ เช่น การหมุนเวียนโปรตีน การซ่อมแซมดีเอ็นเอ และการควบคุมการตอบสนองทางภูมิคุ้มกัน โปรตีนนี้ยังถูกใช้ในการพัฒนาอัสเซย์เพื่อตรวจสอบกิจกรรมเอนไซม์ โดยเฉพาะยูบิควิตินไลเกสและเดอubiquitinating enzymes ซึ่งจำเป็นในการวิจัยมะเร็งและโรคเสื่อมถอยของระบบประสาท นอกจากนี้ มันยังเป็นเครื่องมือในชีววิทยาโครงสร้างสำหรับศึกษาการโต้ตอบโปรตีน-โปรตีนและการดัดแปลงหลังแปลรหัส การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการค้นพบยา ที่ซึ่งมันช่วยในการระบุเป้าหมายบำบัดที่เป็นไปได้ที่เกี่ยวข้องกับเส้นทางยูบิควิติน