ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีโครงสร้างเปปไทด์หรือสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านยา ทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญในขั้นตอนการสร้างพันธะเปปไทด์ เนื่องจากมีหมู่ Boc (tert-butoxycarbonyl) ที่ช่วยป้องกันหมู่อะมิโนไม่ให้ทำปฏิกิริยาในขั้นตอนที่ไม่ต้องการ ขณะที่หมู่คาร์บอกซิลิกแอซิดสามารถทำปฏิกิริยากับหมู่อะมิโนของกรดอะมิโนอื่นได้ โครงสร้างที่มีวงแหวนไนโตรฟีนิลช่วยเพิ่มความเฉพาะเจาะจงหรือการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพในบางกรณี จึงนิยมใช้ในสังเคราะห์สารต้นแบบของยาหรือสารยับยั้งเอนไซม์