ใช้เป็นหลักในเคมีทางการแพทย์ (medicinal chemistry) เป็นโครงสร้างแข็งที่เลียนแบบกลุ่มฟีนิลหรือกลุ่มอะโรมาติกอื่นๆ ในการออกแบบยา โครงสร้างลูกบาศก์ที่ไม่เหมือนใครให้ความสมมาตรสูงและความเสถียร เพิ่มความต้านทานต่อการเมแทบอลิซึมและปรับปรุงคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์

ใช้ในการพัฒนายากลุ่มระบบประสาทส่วนกลาง (CNS agents), ยายับยั้งเอนไซม์, และตัวกระตุ้น/ยับยั้งตัวรับ (receptor agonists/antagonists) ซึ่งการวางแนวเชิงอวกาศของกลุ่มฟังก์ชันมีบทบาทสำคัญ

นอกจากนี้ยังมีการสำรวจในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับสร้างสารที่มีความหนาแน่นพลังงานสูงและโพลิเมอร์ขั้นสูง เนื่องจากโครงสร้างไฮโดรคาร์บอนที่ตึงเครียดสูง

โครงสร้างลูกบาศก์ยังเหมาะสำหรับการศึกษาในเคมีอินทรีย์ โดยเฉพาะพฤติกรรมโมเลกุลภายใต้แรงตึงเครียด และใช้เป็นตัวตั้งต้นสำหรับอนุพันธ์คิวเบนในวัสดุขั้นสูง เช่น สารพลังงานสูงที่มีความเสถียร