MK-2048 เป็นสารยับยั้งเอนไซม์ integrase ที่ใช้ในการวิจัยด้านไวรัส HIV โดยเฉพาะในช่วงการพัฒนาของไวรัสหลังจากที่เข้าสู่เซลล์โฮสต์แล้ว สารนี้มีบทบาทสำคัญในการป้องกันการรวมตัวของดีเอ็นเอของไวรัสเข้ากับจีโนมของเซลล์มนุษย์ ซึ่งเป็นขั้นตอนสำคัญในการจำลองตัวของไวรัส ในงานวิจัย MK-2048 มักถูกใช้เพื่อศึกษาประสิทธิภาพของสารยับยั้ง integrase รุ่นใหม่ โดยเฉพาะในเชิงเปรียบเทียบกับยาที่มีอยู่ในปัจจุบัน เช่น raltegravir หรือ dolutegravir ความสามารถในการออกฤทธิ์ยาวนานและรักษาความเข้มข้นในเซลล์ได้ดี ทำให้มันเป็นเครื่องมือที่มีค่าในการพัฒนายาต้านไวรัสที่มีประสิทธิภาพสูงขึ้นและลดโอกาสในการดื้อยา นอกจากนี้ MK-2048 ยังถูกใช้ในการศึกษาโมเดลสัตว์ทดลองเพื่อประเมินการกระจายตัวของยา การดูดซึม และการกำจัดยาจากร่างกาย ซึ่งข้อมูลเหล่านี้ช่วยสนับสนุนการออกแบบยาในระดับคลินิกได้อย่างมีประสิทธิภาพ