นาดิฟลอกซาซินใช้หลัก ๆ เป็นยาต้านแบคทีเรียชนิดทา สำหรับรักษาการติดเชื้อที่ผิวหนัง มีประสิทธิภาพต่อสิว vulgaris โดยเฉพาะที่เกิดจาก Propionibacterium acnes เนื่องจากสามารถยับยั้ง DNA gyrase ของแบคทีเรีย นอกจากนี้ ยังใช้ในการจัดการการติดเชื้อแบคทีเรียรองในภาวะต่าง ๆ เช่น เอคซิมา ผิวหนังอักเสบ และฟอลลิคูไลติสตื้น กิจกรรมแบบ broad-spectrum ต่อแบคทีเรียแกรมบวกและบางชนิดแกรมลบ ทำให้เป็นตัวเลือกที่มีคุณค่า สำหรับการติดเชื้อเฉพาะที่บนผิวหนัง สูตรยามักมีในรูปแบบครีมหรือโลชั่น เพื่อการทาที่เจาะจงและการดูดซึมเข้าสู่ระบบร่างกายน้อยที่สุด