ใช้เนบรามีนในทางการแพทย์เพื่อรักษาการติดเชื้อแบคทีเรีย โดยเฉพาะเชื้อแบคทีเรียแกรมลบ ซึ่งมักใช้ในกรณีที่เชื้อดื้อยาต่อสารปฏิชีวนะชนิดอื่น มักนำมาใช้รักษาการติดเชื้อในระบบทางเดินปัสสาวะ ระบบทางเดินหายใจ และการติดเชื้อในกระแสเลือด อาจใช้ร่วมกับยาปฏิชีวนะชนิดอื่นเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพในการฆ่าเชื้อ อย่างไรก็ตาม เนบรามีนมีผลข้างเคียงต่อไตและหู จึงต้องใช้ภายใต้การควบคุมของแพทย์อย่างใกล้ชิด โดยเฉพาะในผู้ป่วยที่มีปัญหาเกี่ยวกับการทำงานของไต