ใช้หลักในยาสัตวแพทย์เป็นยาปฏิชีวนะในการรักษาการติดเชื้อแบคทีเรีย โดยเฉพาะแบคทีเรียแกรมบวก ในสุกรและสัตว์ปีก มีประสิทธิภาพต่อเชื้อก่อโรคเช่น Staphylococcus, Streptococcus และ Clostridium ชนิดต่างๆ Lincomycin B Hydrochloride บริหารให้ทางอาหาร น้ำ หรือฉีด เพื่อจัดการกับการติดเชื้อทางเดินหายใจ ทางเดินอาหาร และการติดเชื้อทั่วร่างกาย การใช้ในสัตว์ช่วยปรับปรุงสมรรถนะการเจริญเติบโตและป้องกันการระบาดของโรคในระบบการเลี้ยงสัตว์แบบเข้มข้น เนื่องจากมีโอกาสเกิดการดื้อยาข้ามกับลินโคซาไมด์อื่นๆ การใช้งานจึงมักถูกตรวจสอบเพื่อรักษาประสิทธิภาพและลดความเสี่ยงของการดื้อยา