ไอโอโนมัยซิน แคลเซียม ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีววิทยาในฐานะไอโอโนโฟร์แคลเซียมที่มีศักยภาพสูง มันช่วยอำนวยการขนส่งไอออนแคลเซียมข้ามเยื่อหุ้มเซลล์ ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าตในการศึกษากลไกการส่งสัญญาณแคลเซียมในเซลล์ นักวิจัยมักใช้มันเพื่อเหนี่ยวนำการไหลเข้าของแคลเซียมในการทดลอง ช่วยให้เข้าใจบทบาทของแคลเซียมในกระบวนการเซลล์ เช่น การตายของเซลล์แบบโปรแกรม (apoptosis) การตอบสนองทางภูมิคุ้มกัน และการกระตุ้นเซลล์ มันมีประโยชน์โดยเฉพาะในอิมมูโนโลยีสำหรับการกระตุ้นเซลล์ T และศึกษาพฤติกรรมของเซลล์เหล่านั้น นอกจากนี้ ไอโอโนมัยซิน แคลเซียม ยังใช้ร่วมกับตัวแทนอื่นๆ เช่น โฟร์บอลเอสเตอร์ เพื่อกระตุ้นเส้นทางโปรตีนไคเนส C ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับการสื่อสารและการทำงานของเซลล์ ความสามารถในการปรับระดับแคลเซียมภายในเซลล์ทำให้เป็นสารเคมีสำคัญในศึกษาทางชีวเคมีและเภสัชวิทยาต่างๆ