สารละลายเฮกซะเมโทเนียมไฮดรอกไซด์ถูกนำมาใช้ในการศึกษาทางเภสัชวิทยาและสรีรวิทยา โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการวิจัยเกี่ยวกับระบบประสาทอัตโนมัติ เนื่องจากมีคุณสมบัติในการยับยั้งการทำงานของนิโคตินิกอะเซทิลโคลีนรีเซพเตอร์ ซึ่งช่วยในการศึกษาการส่งสัญญาณประสาทและการควบคุมการทำงานของอวัยวะต่าง ๆ เช่น หัวใจและหลอดเลือด นอกจากนี้ยังมีการใช้ในการทดลองเพื่อศึกษาผลกระทบต่อความดันโลหิตและระบบไหลเวียนเลือดในสัตว์ทดลองอีกด้วย