Validamycin ใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารกำจัดเชื้อราในเกษตรกรรม โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประสิทธิภาพต่อเชื้อก่อโรคในดิน เช่น Rhizoctonia solani ซึ่งก่อให้เกิดโรคเน่าคอรากในข้าว มันทำงานโดยยับยั้งการเจริญเติบโตของเชื้อรา ช่วยปกป้องพืชและเพิ่มผลผลิต นอกจากนี้ ยังใช้ในการควบคุมโรคในพืชอื่นๆ เช่น มันฝรั่ง หญ้าคลุมสนาม และบีทน้ำตาล ความเป็นพิษต่ำต่อสิ่งมีชีวิตที่ไม่ใช่เป้าหมายและสิ่งแวดล้อม ทำให้เป็นตัวเลือกที่ชื่นชอบในระบบการจัดการศัตรูพืชแบบผสมผสาน Validamycin ยังถูกสำรวจสำหรับการใช้งานทางการแพทย์ โดยเฉพาะในงานวิจัยที่เกี่ยวข้องกับการยับยั้งเอนไซม์และการจัดการเบาหวาน เนื่องจากความสามารถในการรบกวนการเผาผลาญคาร์โบไฮเดรต