แพนครีเอตินใช้อย่างแพร่หลายในสาขาการแพทย์และเภสัชกรรมเป็นตัวช่วยย่อยอาหารสำหรับผู้ที่มีปัญหาการผลิตเอนไซม์ย่อยอาหารไม่เพียงพอ เช่น ผู้ป่วยโรคซิสติก ไฟโบรซิส (cystic fibrosis) โรคตับอ่อนอักเสบเรื้อรัง หรือหลังการผ่าตัดตับอ่อน ช่วยสลายไขมัน โปรตีน และคาร์โบไฮเดรตในระบบย่อยอาหาร ปรับปรุงการดูดซึมสารอาหาร และบรรเทาอาการ เช่น ท้องอืด ท้องเสีย และปัญหาการย่อยอาหาร นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมอาหารเป็นอาหารเสริมเอนไซม์เพื่อเพิ่มการย่อยของผลิตภัณฑ์อาหารบางชนิด เช่น การทำชีสหรือการหมักเบียร์ นอกจากนั้นยังนำไปใช้ในอุตสาหกรรมชีวภาพและห้องปฏิบัติการวิจัยสำหรับการย่อยโปรตีนและการศึกษาเซลล์ช่วยในการเตรียมตัวอย่างสำหรับการวิเคราะห์ คุณสมบัติเอนไซม์ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในกระบวนการทางวิทยาศาสตร์และอุตสาหกรรมต่างๆ