ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง โดยเฉพาะในเทคนิค Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ซึ่งสารนี้ทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโน N-เมทิล โดยเฉพาะอะนาล็อกของอาร์จินีน ที่ถูกป้องกันหมู่อะมิโนด้วยหมู่ Fmoc และมีหมู่ป้องกันพิเศษที่หมู่ด้านข้าง (Pbf: 2,2,4,6,7-pentamethyl-2,3-dihydrobenzofuran-5-yl)sulfonyl บนหมู่กวนิดีน เพื่อป้องกันการเกิดปฏิกิริยาที่ไม่ต้องการระหว่างการสังเคราะห์เปปไทด์ เหมาะสำหรับการสร้างเปปไทด์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน เนื่องจากหมู่ซัลโฟนิลกวนิดิโนที่เสถียรและสามารถถอดหมู่ป้องกันได้ภายใต้สภาวะที่อ่อนโยน (mild conditions) ทำให้รักษารูปแบบของเปปไทด์ไว้ได้ดี การมี N-เมทิลช่วยเพิ่มความยืดหยุ่นของโครงสร้างเปปไทด์และความเสถียรทางเมแทบอลิซึม นิยมใช้ในงานวิจัยด้านชีวเคมีและพัฒนายาที่ต้องการความบริสุทธิ์สูง เช่น สารยับยั้งเอนไซม์ ซับสเตรตของโปรติเอส และลิแกนด์ของรีเซปเตอร์