ใช้ในสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านชีววิทยาโมเลกุลและเภสัชกรรม เนื่องจากหมู่ Fmoc ช่วยป้องกันหมู่อะมิโนในระหว่างการสังเคราะห์ ทำให้สามารถสร้างเปปไทด์ได้อย่างมีประสิทธิภาพ โครงสร้างที่มีฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรและความสามารถในการผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ จึงเหมาะสำหรับการพัฒนายาที่ต้องการการดูดซึมดีและต้านการสลายตัวในร่างกาย นิยมใช้ในงานออกแบบเปปไทด์ที่ต้องการคุณสมบัติพิเศษ เช่น การจับกับโปรตีนเป้าหมายอย่างเฉพาะเจาะจง