ใช้ในสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง โดยทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยของกรดอะมิโนที่มีการป้องกันกลุ่มแอมิโนด้วยหมู่ Fmoc ซึ่งช่วยควบคุมการสังเคราะห์ให้เกิดขึ้นตามลำดับที่ต้องการ นิยมใช้ในงานวิจัยด้านชีวเคมีและเภสัชกรรมเพื่อสร้างเปปไทด์ที่มีโครงสร้างเฉพาะ โดยเฉพาะในกรณีที่ต้องการความคงตัวต่อเอนไซม์หรือปรับปรุงคุณสมบัติด้านชีวภาพ Fmoc-D-Pip-OH ช่วยเพิ่มความเสถียรของโครงสร้างเปปไทด์เนื่องจากเป็นอนุพันธ์ของ D-กรดอะมิโน ที่ไม่ถูกย่อยสลายง่ายโดยโปรตีเอสในร่างกาย