สารเคมีนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะกลุ่มปกป้องสำหรับอะมีน กลุ่มเทอร์ต-บิวทิลให้ความเสถียรภายใต้สภาวะปฏิกิริยาต่างๆ ช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนกลุ่มฟังก์ชันอื่นๆ ในโมเลกุลได้อย่างเลือกสรร โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประโยชน์ในการสังเคราะห์เปปไทด์ ซึ่งปกป้องกลุ่มอะมีนระหว่างการสร้างพันธะเปปไทด์ นอกจากนี้ ส่วน pent-4-yn-1-yl สามารถเข้าร่วมในปฏิกิริยาเคมีแบบคลิก เช่น การ cycloaddition ระหว่างอะซายด์-อัลไคน์ที่ใช้ทองแดงเป็นตัวเร่งปฏิกิริยา ซึ่งช่วยให้สามารถติดตั้งกลุ่มฟังก์ชันหลากหลายหรือไบโอโมเลกุลได้ ทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนายา สารชีวภาพเชื่อมโยง (bioconjugation) และวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน