บรอมโมเมทิลเมทิลอีเทอร์ (MOM-Br) ใช้หลักๆ เป็นรีเอเจนต์ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อนำกลุ่มปกป้องเมทอกซิเมทิล (MOM) เข้าสู่โมเลกุล โดยเฉพาะกับแอลกอฮอล์ อะมีน และกรดคาร์บอกซิลิก ซึ่งช่วยปกป้องหมู่ฟังก์ชันที่ตอบสนองได้ในกระบวนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน มีคุณค่าอย่างยิ่งในการผลิตยา ช่วยให้สามารถปรับโครงสร้างโมเลกุลยาที่ซับซ้อนได้โดยไม่ถูกรบกวนจากหมู่ที่ไม่ได้รับการปกป้อง นอกจากนี้ ยังใช้เป็นสารอัลคิลเลติ้งในการเตรียมเอเทอร์และสารเคมีละเอียด รวมถึงการสังเคราะห์สารเคมีทางการเกษตรและผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติ เนื่องจากมีปฏิกิริยาสูง ทำให้เกิดการระคายเคืองตา และอาจก่อให้เกิดมะเร็ง จึงต้องจัดการอย่างระมัดระวังในห้องปฏิบัติการที่ควบคุม