2-Methoxyethoxymethyl chloride ใช้หลักๆ เป็นรีเอเจนต์สำหรับการป้องกันกลุ่มในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประสิทธิภาพในการป้องกันกลุ่มไฮดรอกซิลระหว่างปฏิกิริยาเคมีที่ซับซ้อน สารเคมีนี้มีบทบาทสำคัญในการสังเคราะห์ยา ซึ่งช่วยในการทำให้สารกลางที่ไวต่อสภาวะปฏิกิริยาที่รุนแรงมีความเสถียร นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในการผลิตสารเคมีละเอียดและสารเคมีเกษตร ซึ่งต้องการการควบคุมโครงสร้างโมเลกุลอย่างแม่นยำ ความสามารถในการถอดออกได้ง่ายภายใต้สภาวะอ่อนโยนทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในกระบวนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน เพื่อรักษาความสมบูรณ์ของโมเลกุลเป้าหมาย