สเตรปตาวิดินถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในด้านชีววิทยาโมเลกุลและเทคโนโลยีชีวภาพ เนื่องจากมีความสามารถในการจับกับไบโอตินด้วยความแข็งแรงสูงและจำเพาะเจาะจง จึงมักใช้ในเทคนิคต่างๆ เช่น ELISA, western blot, และการตรวจจับ DNA หรือ RNA ในการทดลองทางพันธุศาสตร์ นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการทำเครื่องหมายเซลล์และการแยกเซลล์ด้วยเทคนิคเช่น flow cytometry และ immunoprecipitation สเตรปตาวิดินยังมีบทบาทสำคัญในนาโนเทคโนโลยีและการพัฒนาชุดตรวจวินิจฉัยทางการแพทย์ เนื่องจากช่วยเพิ่มความแม่นยำและประสิทธิภาพในการตรวจจับโมเลกุลเป้าหมาย