Hexa-His ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในด้านชีวเคมีและอณูชีววิทยา โดยเฉพาะในการศึกษาปฏิกิริยาระหว่างโปรตีนและการทำความสะอาดโปรตีนที่มีแท็ก His-tag ด้วยเทคนิคโครมาโตกราฟีแบบ affinity โดยใช้คอลัมน์ที่ผูกกับนิกเกิลหรือโคบอลต์ เนื่องจาก Hexa-His มีความสามารถในการจับกับไอออนของโลหะเหล่านี้ได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษาการแสดงออกของโปรตีนในระบบเซลล์ และช่วยในการวิเคราะห์โครงสร้างและหน้าที่ของโปรตีนได้อย่างแม่นยำ