ใช้เป็นสารตัวเร่งปฏิกิริยาการจับคู่ที่มีประสิทธิภาพสูงในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) โครงสร้างเบนซีนซัลโฟเนตที่ฟลูออรีนช่วยเพิ่มความละลายและความเสถียรในตัวทำละลายขั้ว ทำให้สามารถกระตุ้นกรดคาร์บอกซิลิกได้อย่างมีประสิทธิภาพ สารนี้ช่วยให้เกิดการสร้างพันธะอะไมด์อย่างรวดเร็ว โดยมี racemization น้อย ทำให้มีคุณค่าต่อการผลิตเปปไทด์และโปรตีนที่ซับซ้อน นอกจากนี้ยังใช้ในการทำปฏิกิริยาการเชื่อมโยงทางชีวภาพ ซึ่งต้องการการจับคู่ที่เลือกสรรและสะอาดภายใต้สภาวะอ่อนโยน เนื่องจากความเลือกสรรทางเคมี จึงได้รับความนิยมในการสังเคราะห์หลายขั้นตอนของยาและโมเลกุลที่กระตุ้นทางชีวภาพ