สารกลางอะลิฟาติกที่ถูกฮาโลเจนแทนที่ทำหน้าที่เป็นบล็อกสร้างที่หลากหลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ ช่วยให้สามารถนำอะตอมฮาโลเจนเข้าไปในโซ่คาร์บอนหรือวงแหวนเพื่อปรับปรุงคุณสมบัติโมเลกุล เช่น ความเสถียรและปฏิกิริยาในการพัฒนายาเภสัชภัณฑ์