ใช้เป็นตัวทำปฏิกิริยาในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์ที่ต้องการควบคุมการเกิดปฏิกิริยาของหมู่ -SH (thiol group) เนื่องจากหมู่ trimethylsilyl ช่วยป้องกันการออกซิไดซ์หรือการเกิดปฏิกิริยาข้างเคียงได้ดี นิยมใช้ในขั้นตอนการป้องกันหมู่ฟังก์ชัน (protecting group strategy) ในการสร้างสารประกอบเชิงซ้อน เช่น สารชีวโมเลกุลหรือสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในเทคนิคการวิเคราะห์ทางเคมี เช่น การเตรียมตัวอย่างสำหรับการวิเคราะห์ด้วยมวลสเปกโตรเมตรี (mass spectrometry) เพื่อเพิ่มความไวในการตรวจจับสารที่มีหมู่ thiol