ใช้เป็นบล็อกก่อสร้างในกระบวนการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนาโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพและยารักษา โครงสร้างฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและลิโพฟิลิก ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาเพื่อปรับปรุงการดูดซึมยาและความต้านทานต่อการย่อยสลาย ใช้บ่อยในการออกแบบยาสำหรับระบบประสาทส่วนกลางและตัวยับยั้งเอนไซม์เนื่องจากคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ที่ดี เช่น ในยาแก้ซึมเศร้าและยาต้านจิตประสาท นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเคมีเพื่อสร้างยาฆ่าแมลงที่มีประสิทธิภาพและเสถียรยิ่งขึ้น