ใช้ในกระบวนการบำบัดน้ำเสีย โดยเฉพาะในระบบบำบัดน้ำเสียที่ต้องการลดระดับฟอสฟอรัสในน้ำ แบคทีเรียฟอสฟอรัสนี้มีบทบาทสำคัญในการสะสมฟอสฟอรัสในรูปแบบที่ไม่ละลายน้ำได้มากกว่าแบคทีเรียทั่วไป ทำให้สามารถกำจัดฟอสฟอรัสออกจากน้ำได้อย่างมีประสิทธิภาพ นิยมใช้ในระบบบำบัดน้ำเสียแบบเพิ่มประสิทธิภาพ (Enhanced Biological Phosphorus Removal - EBPR) ซึ่งช่วยลดปัญหาการเกิดยูโทรฟิเคชัน (Eutrophication) ในแหล่งน้ำธรรมชาติ เช่น แม่น้ำ บึง และทะเลสาบ นอกจากนี้ยังใช้ในระบบเกษตรอินทรีย์เพื่อช่วยปลดปล่อยฟอสฟอรัสที่จับอยู่ในดินให้อยู่ในรูปที่พืชสามารถดูดซึมไปใช้ได้ ช่วยเพิ่มผลผลิตพืชโดยไม่ต้องพึ่งปุ๋ยเคมีฟอสฟอรัสมากนัก ยังสามารถประยุกต์ใช้ในผลิตภัณฑ์ชีวภาพเพื่อปรับปรุงคุณภาพดินและน้ำในระบบเกษตรกรรมยั่งยืนอีกด้วย