ไซโคลเฮกซิลยูเรียมีการนำไปใช้ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมในฐานะสารกลางในการสังเคราะห์ยาต่าง ๆ โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประโยชน์ในการผลิตสารประกอบที่มีผลทางบำบัดที่มีศักยภาพ เช่น ยาต้านชักและยาต้านการอักเสบ นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในเคมีอินทรีย์สำหรับการพัฒนาโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น รวมถึงที่ใช้ในการวิจัยและพัฒนายาใหม่ ๆ บทบาทของมันในการสังเคราะห์ทางเคมีเน้นย้ำถึงความสำคัญในการส่งเสริมการนวัตกรรมทางการแพทย์และเภสัชกรรม