N-sec-Butylurea ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางในการผลิตเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตรต่างๆ มันมีบทบาทในการพัฒนาสารประกอบที่มีคุณสมบัติทางรักษา เช่น ตัวยับยั้งเอนไซม์หรือตัวปรับตัวรับ ในภาคเกษตร มันถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์สารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง ซึ่งช่วยในการควบคุมวัชพืชและศัตรูพืชในการจัดการพืชผล นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการวิจัยและพัฒนาเพื่อศึกษาการตอบสนองทางเคมีและกลไก ซึ่งช่วยในการค้นพบวัสดุและกระบวนการใหม่ๆ