1,3-Bis(4-fluorophenyl)urea ใช้หลักในการวิจัยทางเคมียารักษาและเภสัชกรรม เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพต่างๆ โดยเฉพาะที่มุ่งเป้าไปที่การยับยั้งเอนไซม์และการปรับเปลี่ยนตัวรับ โครงสร้างของมันมักถูกสำรวจในการพัฒนายาเพื่อการรักษาที่มีศักยภาพ รวมถึงยาต้านมะเร็งและยาต้านการอักเสบ นักวิจัยยังศึกษาคุณสมบัติของมันเพื่อออกแบบโมเลกุลใหม่ที่มีประสิทธิภาพและความเลือกเฉพาะเจาะจงที่ดียิ่งขึ้นสำหรับเป้าหมายทางชีวภาพเฉพาะ นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างสารเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น