(2-Aminoethyl)urea hydrochloride ใช้ในงานวิจัยทางเคมีและชีวเคมีเป็นหลัก โดยเฉพาะในการสังเคราะห์สารประกอบต่าง ๆ ที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการทางชีวภาพ เนื่องจากมีกลุ่มฟังก์ชันที่สามารถทำปฏิกิริยาได้หลากหลาย ทำให้เหมาะสำหรับการปรับเปลี่ยนโครงสร้างโมเลกุลหรือการสร้างสารตัวกลางในกระบวนการสังเคราะห์ นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในการศึกษาปฏิกิริยาของเอนไซม์หรือกระบวนการเมแทบอลิซึมในเซลล์ โดยเป็นส่วนหนึ่งของการออกแบบโมเลกุลเพื่อพัฒนายาใหม่ ๆ หรือสารเคมีที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง