ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาที่มีโครงสร้างเป็นพิเพอริดีน ซึ่งมักพบในยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านอาการซึมเศร้า ยาแก้ปวด หรือยาต้านอาการวิตกกังวล กลุ่ม tert-butoxycarbonyl (Boc) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกัน (protecting group) ที่ช่วยควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะตำแหน่งในโมเลกุล ทำให้สามารถสร้างพันธะใหม่ได้อย่างแม่นยำก่อนจะถอดกลุ่มป้องกันออกในขั้นตอนถัดไป จึงนิยมใช้ในสังเคราะห์แบบขั้นตอนหลายขั้น (multi-step synthesis) ที่ต้องการความเฉพาะเจาะจงสูง