ใช้เป็นตัวป้องกันหมู่ไฮดรอกซี (protecting group) ในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในกระบวนการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน เช่น การสังเคราะห์สารชีวโมเลกุลหรือยา ตัวหมู่ tert-butyldimethylsilyl (TBS) มีความเสถียรต่อสภาวะเบสและตัวทำละลายบางชนิด ทำให้สามารถควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะจุดในโมเลกุลได้ การป้องกันหมู่ -OH ด้วยสารนี้ช่วยป้องกันไม่ให้เกิดปฏิกิริยาข้างเคียงในขั้นตอนการสังเคราะห์ และสามารถถอดออกได้ภายหลังด้วยตัวทำละลายที่มีฟลูออไรด์ เช่น TBAF (tetrabutylammonium fluoride) อย่างมีประสิทธิภาพ