ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบเปปไทด์และสารที่มีโครงสร้างคล้ายเปปไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นตัวป้องกันหมู่อะมิโน (amine protecting group) ซึ่งช่วยควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะตำแหน่งที่ต้องการในขั้นตอนการสร้างพันธะเปปไทด์ โครงสร้างที่มีหมู่ tert-butyl carbamate (Boc) ทำให้สามารถกำจัดตัวป้องกันออกได้ภายใต้สภาวะกรดอ่อน ซึ่งเหมาะสำหรับการสังเคราะห์แบบขั้นตอนเดียว (stepwise synthesis) โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมและชีววิทยาโมเลกุลที่ต้องการความบริสุทธิ์และเลือกจำเพาะสูง