ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาที่มีโครงสร้างพิเพอริดีน ซึ่งมักพบในยาประเภทต่างๆ เช่น ยาแก้ปวด ยาคลายกังวล หรือยาทางระบบประสาทส่วนกลาง เนื่องจากหมู่ tert-butyl carboxylate ทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกัน (protecting group) สำหรับไนโตรเจนในพิเพอริดีน จึงช่วยควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะตำแหน่งได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ หมู่คลอโรมีทิลสามารถทำปฏิกิริยาต่อไปได้ เช่น การแทนที่ด้วยนิวคลีโอไฟล์ ทำให้สามารถต่อเติมโครงสร้างโมเลกุลได้หลากหลาย จึงเป็นสารตั้งต้นที่มีประโยชน์ในงานวิจัยและพัฒนายาใหม่