ใช้เป็นสารตั้งต้นหลักในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มีฐานพิริดีนฟลูออรีน หมู่ฮาโลเจนและฟลูออรีนช่วยให้เกิดปฏิกิริยาครอส-คัปพลิงแบบเลือกเพศ ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน ใช้บ่อยในการเตรียมตัวยับยั้งคินาสและสารประกอบชีวภาพอื่นๆ โดยที่ฮีเทอโรไซเคิลฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสัมพันธ์ในการจับคู่ นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยเกษตรเคมีสำหรับออกแบบยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ที่มีประสิทธิภาพดีขึ้นและโปรไฟล์สิ่งแวดล้อมที่ดีขึ้น