ใช้เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ โดยเฉพาะในการวิจัยเภสัชกรรม โครงสร้างของมันสนับสนุนการพัฒนายับยั้งโปรติเอสและยาตัวอื่นๆ ที่มุ่งเป้าไปที่โรคเมแทบอลิซึมและโรคติดเชื้อ ใจกลางอะเซ็ทิดีนฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความเลือกในการจับ ทำให้มีคุณค่าในการปรับปรุงคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ ใช้กันทั่วไปในเคมียารักษาเพื่อสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่ต้องการโครงนั่งร้านที่แข็งและมีขั้ว